С 2026 года сотрудники лаборатории энтеральных вирусных инфекций приступили к исследовательской работе по двум новым темам НИР: «Эпидемиологическая характеристика острых кишечных инфекций вирусной этиологии у детей в возрасте до 5 лет, видовое и генетическое разнообразие возбудителей» и «Генетическое разнообразие и филодинамика неполиомиелитных энтеровирусов на территории Уральского федерального округа и Западной Сибири».
Тема НИР «Эпидемиологическая характеристика острых кишечных инфекций вирусной этиологии у детей в возрасте до 5 лет, видовое и генетическое разнообразие возбудителей»
Цель – Изучение эпидемиологических особенностей (распространенность, сезонность циркуляции), видового и генетического разнообразия возбудителей острых кишечных инфекций (ОКИ) вирусной этиологии у детей в возрасте до 5 лет на территории Уральского федерального округа.
Актуальность проблемы: Гастроэнтерит является серьезной проблемой здравоохранения во всем мире, поражающей людей в любом возрасте, но особенно тяжело он протекает среди детей и пожилых людей. По указу Президента Российской Федерации от 07.05.2024 № 309 «О национальных целях развития Российской Федерации до 2030 года и на перспективу до 2036 года», сохранение населения, укрепление здоровья и повышение благополучия людей, поддержка семьи являются национальными целями развития Российской Федерации. По данным государственных докладов за 9 лет с 2011 по 2019 гг. средний уровень заболеваемости всеми ОКИ составил 553,92 случаев на 100 тысяч населения. Причем ОКИ неустановленной этиологии составляют 64,25% от всех ОКИ (Государственный доклад «О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской̆ Федерации в 2019 году»). Высокий уровень заболеваемости диарейными инфекциями, наличие групповых очагов, низкая этиологическая расшифровка и отсутствие тенденции к снижению заболеваемости, свидетельствуют о низкой эффективности существующих профилактических мер мероприятий в современных условиях, а, следовательно, о наличии рисков осложнения эпидемической обстановки по ОКИ.
Общеизвестно, что вирусные агенты занимают существенное место в этиологической структуре острых кишечных инфекций у лиц различного возраста особенно у детей. Среди всех возбудителей гастроэнтерита на долю вирусов приходится примерно 70% острых случаев у детей с ротавирусом (РВ), норовирусом (NoV) и аденовирусом (AdV), на долю которых приходится большинство случаев (Oppong et al, 2020), с увеличением астровируса (AstV) и саповируса (SaV) в тех же возрастных группах (Chhabra et al, 2013).
Ожидаемые результаты по НИР: Впервые будет проведён комплексный анализ территориального, возрастного и временного распределения заболеваемости кишечными инфекциями вирусной этиологии у детей до 5 лет на территории УрФО. Впервые будут проведен полногеномный анализ образцов фекалии у детей с ОКИ неустановленной вирусной этиологии на территории РФ в УФО.
Тема НИР «Генетическое разнообразие и филодинамика неполиомиелитных энтеровирусов на территории Уральского федерального округа и Западной Сибири»
Цель – Совершенствование эпидемиологического надзора за энтеровирусной (неполио) инфекции на основе изучения генетического разнообразия и филодинамики неполиомиелитных энтеровирусов
Актуальность проблемы: Неполиомиелитные энтеровирусы (НПЭВ) с известной ролью в патологии человека представлены более ста двадцатью типами мелких, безоболочечных, РНК-содержащих вирусов. На основании молекулярно-генетических характеристик они объединены в четыре вида (A, B, C, D) рода Enterovirus семейства Picornaviridae порядка Picornavirales (Zell, 2017). Ранее Всемирная организация здравоохранения, в 2018 году наравне с аренавирусными геморрагическими лихорадками, лихорадкой Чикунгунья, высокопатогенными коронавирусными заболеваниями и тяжелой лихорадкой с синдромом тромбоцитопении, внесла эмерджентные неполиомиелитные энтеровирусы (включая EV71, D68), в качестве кандидатов, в «Список возбудителей, требующих немедленного приложения научных усилий». По мнению специалистов ВОЗ, эти заболевания представляют серьезную угрозу для здоровья населения и требуют дальнейших исследований в области эпидемиологического надзора и диагностики (Mehand, 2018).
Согласно санитарным правилам СП 3.1.2950-11 от 27.07.2011 «Профилактика энтеровирусной (неполио) инфекции», неотъемлемой составляющей эффективного Государственного санитарно-эпидемиологического надзора за энтеровирусной инфекцией (ЭВИ), является организация мониторинга за биологическими свойствами возбудителей ЭВИ, включая точное типирование и информативные молекулярно-эпидемиологические исследования. Мониторинг осуществляется на штаммах, выделенных из проб биологического материала и из объектов окружающей среды (сточные воды). Последнее служит как комплементарная мера для повышения информативности надзора за циркуляцией НПЭВ в тех условиях, когда диагностика заболевания недостаточна или затруднена. Существует консенсус научного сообщества, согласно которому непрерывный надзор за циркуляцией НПЭВ требуется 1) для идентификации энтеровирусов, ассоциированных с более тяжелыми заболеваниями; 2) для идентификации энтеровирусов, связанных со вспышками заболеваний; 3) для подтверждения свободного от полиомиелита статуса; 4) для изучения молекулярной эпидемиологии и географического распределения циркулирующих типов и штаммов НПЭВ, особенно связанных с тяжелыми формами заболевания; 5) для обнаружения и отслеживания появления новых штаммов и их рекомбинантных форм (Harvala et al, 2018).
Ожидаемые результаты по НИР: Будут получены данные о распределении актуальных НПЭВ по генотипам, их генетическом разнообразии, свойствах, а также соотнесение полученных данных с ретроспективными. Будут получены данные о генетической изменчивости циркулирующих энтеровирусов, ее взаимосвязи с появлением очагов групповой заболеваемости, влияния на генетическую изменчивость появление рекомбинантных форм. Будет разработана новая методика обнаружения и генотипирования энтеровирусов в водных объектах, характеризующаяся высокой чувствительностью детекции и воспроизводимостью результатов. По результатам выполнения НИР ожидается регистрация базы данных и изобретения.