Исследования в рамках тем НИР
Тема НИР «Комплексная система выявления фенотипической и генотипической резистентности штаммов ВИЧ»
Прикладная научно-исследовательская работа.
Цель – создание комплексной системы выявления фенотипической и генотипической резистентности ВИЧ-1.
Ожидаемые результаты по НИР: будет разработана система определения фенотипической резистентности HCV к противовирусным препаратам, позволяющая проводить доклинические исследования кандидатных лекарственных препаратов, ингибирующих ферменты жизненного цикла HCV, устанавливать связь мутаций полиморфизма с фенотипической резистентностью. Будет создана тест-система для секвенирования фрагментов генома HCV, кодирующих белки РНК-протеазу (NS3/4A), РНК-зависимую-РНК-полимеразу (NS5B). Будет разработана отечественная скоринговая база данных и web-сервис для определения генотипической резистентности ВГС, обновляемая за счёт исследований с помощью созданной системы определения фенотипической резистентности HCV. Внедрение системы определения резистентности HCV позволит скорректировать стратегии лечения, которое в настоящий момент выступает как один наиболее эффективных профилактических подходов, снижающих бремя гепатита C на популяцию. При адекватном подборе ПППД, основанном в том числе на знании о выявленных и/или наиболее распространённых мутациях лекарственной устойчивости, обеспечивается полная элиминация вируса из организма, снижается распространение инфекции среди населения.
Тема НИР «Оценка распространённости оккультной формы гепатита B в отдельных группах населения»
Прикладная научно-исследовательская работа.
Цель – оценить распространенность оккультной формы гепатита B в отдельных группах населения.
Ожидаемые результаты по НИР: будет разработана высокочувствительная тест-система для выявления оккультной формы вирусного гепатита B, доступная для применения в любой ПЦР лаборатории и позволяющая осуществлять масштабный скрининг, будет оценена распространенность оккультной формы вирусного гепатита B в наиболее неблагополучных регионах по гемоконтактным вирусным инфекциям, будет создана стандартная панель с известными концентрациями вируса гепатита B, которая обеспечит проведение как внешнелабораторного так и внутрилабораторного контроля качества выявления гепатита В молекулярно-генетическими методами.
Масштабное выявление скрытых форм гепатита В среди доноров позволит избежать распространения данной инфекции среди населения, а выявление оккультного гепатита В среди лиц из групп риска позволит провести им своевременное лечение прервать дальнейшую передачу вируса и предупредить развитие таких осложнений как гепатоцеллюлярная карцинома и цирроз печени.
Тема НИР «Система определения фенотипической резистентности вируса гепатита С»
Прикладная научно-исследовательская работа.
Цель – создание системы определения фенотипической резистентности ВГС для установления связи мутаций полиморфизма с резистентностью к противовирусным лекарственным препаратом, а также для оценки эффективности лекарственных кандидатов.
Ожидаемые результаты по НИР: будет разработана система определения фенотипической резистентности HCV к противовирусным препаратам, позволяющая проводить доклинические исследования кандидатных лекарственных препаратов, ингибирующих ферменты жизненного цикла HCV, устанавливать связь мутаций полиморфизма с фенотипической резистентностью. Будет создана тест-система для секвенирования фрагментов генома HCV, кодирующих белки РНК-протеазу (NS3/4A), РНК-зависимую-РНК-полимеразу (NS5B). Будет разработана отечественная скоринговая база данных и web-сервис для определения генотипической резистентности ВГС, обновляемая за счёт исследований с помощью созданной системы определения фенотипической резистентности HCV. Внедрение системы определения резистентности ВГС позволит скорректировать стратегии лечения, которое в настоящий момент выступает как один наиболее эффективных профилактических подходов, снижающих бремя гепатита C на популяцию. При адекватном подборе ПППД, основанном в том числе на знании о выявленных и/или наиболее распространённых мутациях лекарственной устойчивости, обеспечивается полная элиминация вируса из организма, снижается распространение инфекции среди населения.
Тема НИР «Влияние цитокинов на структуру теломер клеток лейкоцитарной фракции крови при вирусных инфекциях»
Фундаментальная научно-исследовательская работа
Цель – анализ истощения функциональных возможностей иммунной системы в условиях воздействия на организм острых и хронических вирусных инфекций и создание новых подходов к иммунотерапии лиц, после перенесённого заболевания вирусной этиологии и при длительной персистенции вируса, прояснение возможной роли цитокинов в качестве периферических маркеров воспаления, способных оказывать действие на изменение длины теломер клеток лейкоцитарной фракции периферической крови.
Ожидаемые результаты по НИР: будет разработана и апробирована методика исследования оценки степени метилирования целевых генов путем анализа кривых плавления MS-HRM после бисульфитной конверсии. Будет разработана и апробирована методика анализа относительной длины теломер при помощи ПЦР в реальном времени. Методики исследования длины теломер и степени метилирования ДНК будут объединены в комплексную тест-систему для оценки уровня клеточного старения, которая будет зарегистрирована. Будут получены новые данные о роли аутореактивных клонов В-лимфоцитов (CD45, CD19, CD5, mIgM), NK и TNK (CD3+, 16+, 56+ и (CD3-, 16+, 56+), T-reg (CD3+, CD4+, CD25+, CD127 dimtoneg), Т-клеток их активационных маркеров в периферической крови: (CD45, CD3, CD4, CD8, CD25, CD127, HLA-DR), Т- и В-клеток памяти CD27, CD62L,CD45RA, цитокиновой регуляции нарушений иммунной системы на уровне организма так и местного иммунитета слизистой ротоглотки у ВИЧ-инфицированных лиц, перенесших SARS-CoV-2 с персистенцией вирусов в носоглотке. Будут получены данные о формировании механизмов постковидного и ВИЧ-ассоциированного клеточного и гуморального иммунных ответов. Будут получены новые данные о влиянии цитокинов на изменение теломерных участков хромосом. На основе полученных результатов будет расширена теория патогенеза острых и хронических вирусных инфекций, сформулирована новая концепция, интегрирующая механизмы иммунопатогенеза «постковидного синдрома» у ВИЧ-инфицированных лиц, перенесших SARS-CoV-2 на основе анализа изменений иммунного статуса, специфического иммунного ответа и расшифровки новых молекулярных механизмов инвазии герпетических вирусов, связанных с взаимодействием вирусов с клетками иммунной системы.